67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1858 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1858  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
196 aa  391  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642234  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 
206 aa  124  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  38.42 
 
 
197 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
145 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  29.53 
 
 
208 aa  92.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2911  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 
218 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233066  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
224 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  35.91 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  35.91 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  35.36 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
212 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
212 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  35.52 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  35.52 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  35.52 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  35.52 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  35.52 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  35.52 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  29.74 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
181 aa  62  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0504  transcriptional regulator, TrmB  25.66 
 
 
176 aa  56.2  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.21026 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  29.44 
 
 
186 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  30.39 
 
 
186 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4303  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 
152 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0958  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
152 aa  47.8  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0861  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
152 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0900  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
152 aa  47.8  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1040  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 
152 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69196e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0879  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
152 aa  48.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.544594  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2233  transcriptional regulatory protein  29.25 
 
 
151 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  24.3 
 
 
152 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1128  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 
152 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
141 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1001  transcriptional regulator, MarR family  24.3 
 
 
152 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
142 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0550  regulatory protein, MarR  28.33 
 
 
175 aa  47  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0117945  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
159 aa  45.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
141 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
190 aa  44.7  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  35.24 
 
 
164 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 
146 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  22.83 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 
144 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
164 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4905  putative transcriptional regulator  23.66 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 
161 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
191 aa  42.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
188 aa  42.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
324 aa  42  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
190 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  41.6  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
158 aa  41.2  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0948  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
177 aa  41.2  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
151 aa  41.6  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>