200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0853 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
152 aa  303  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1001  transcriptional regulator, MarR family  93.42 
 
 
152 aa  288  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0879  MarR family transcriptional regulator  90.13 
 
 
152 aa  281  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.544594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0861  MarR family transcriptional regulator  90.13 
 
 
152 aa  281  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1040  transcriptional regulator, MarR family  89.47 
 
 
152 aa  278  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69196e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0900  MarR family transcriptional regulator  88.82 
 
 
152 aa  276  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0958  MarR family transcriptional regulator  88.82 
 
 
152 aa  276  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1128  transcriptional regulator, MarR family  88.82 
 
 
152 aa  276  8e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4303  transcriptional regulator, MarR family  89.47 
 
 
152 aa  274  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1045  MarR family transcriptional regulator  87.5 
 
 
152 aa  273  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.734934  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
163 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
163 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
163 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
163 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 
143 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
164 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
165 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
155 aa  53.9  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 
141 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 
142 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
157 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 
150 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
180 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  22.38 
 
 
159 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  21.15 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  23.81 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  26.26 
 
 
157 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 
171 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  20.72 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3824  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.765459  normal  0.539735 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2391  transcriptional regulator, MarR family protein  37.97 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.515688  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  22.14 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  28.41 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  21.14 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  21.58 
 
 
303 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  22.73 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  24.35 
 
 
148 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  17.39 
 
 
174 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  20.77 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1858  MarR family transcriptional regulator  24.3 
 
 
196 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642234  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  23.66 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  31.43 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  18.6 
 
 
172 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0782  putative helix-turn-helix transcriptional regulator  25 
 
 
162 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  26.56 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  25.6 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  25.6 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  22.77 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  24.59 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  20.93 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  24.14 
 
 
206 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  27.35 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  20.72 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1629  transcriptional regulator  28.04 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000386217  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07740  transcriptional regulator  27.1 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.339553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  21.64 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  22.05 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  23.42 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  23.42 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  22.83 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0187  MarR family transcriptional regulator  24.66 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  24.51 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
313 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  31.75 
 
 
207 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  22.34 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  29.11 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  21.17 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
161 aa  44.3  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  20.61 
 
 
138 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
352 aa  44.3  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  22.05 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 
157 aa  44.3  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  18.49 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  24.47 
 
 
334 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  25.37 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>