241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3697 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3824  MarR family transcriptional regulator  99.44 
 
 		 180 aa  361  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.765459  normal  0.539735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  96.67 
 
 		 180 aa  353  6.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 195 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0501  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  29.37 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0540  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0324  regulatory protein, MarR  22.92 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0087  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.383416 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  30.28 
 
 		 162 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1045  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 152 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.734934  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 141 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 141 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 141 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2296  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 		 173 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0879  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 152 aa  51.6  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.544594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0861  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 152 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  27.42 
 
 		 137 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1128  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 152 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1790  transcriptional regulator, MarR family  24.38 
 
 		 174 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1040  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 152 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69196e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0900  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 152 aa  51.2  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0958  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 152 aa  51.2  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2140  regulatory protein, MarR  29.09 
 
 		 173 aa  51.2  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3280  MarR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 177 aa  51.2  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  0.011902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 168 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1001  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 138 aa  50.8  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 151 aa  50.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  29.1 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2144  MarR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0843453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  30.77 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 137 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 137 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 152 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  26.4 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 158 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 158 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 142 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 142 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3908  transcriptional regulator, MarR family  25.27 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  23.72 
 
 		 172 aa  48.9  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  24.24 
 
 		 142 aa  48.5  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 194 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 149 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 194 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2643  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  48.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 165 aa  47.8  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  29.03 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3618  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  27.2 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  27.87 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4303  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 277 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 160 aa  46.2  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 		 135 aa  45.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 139 aa  45.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  26.12 
 
 		 144 aa  45.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 168 aa  45.1  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  29.55 
 
 		 144 aa  45.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 		 153 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  24.51 
 
 		 157 aa  45.1  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 152 aa  44.7  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>