74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0493 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  425  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  88.78 
 
 		 217 aa  363  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  71.27 
 
 		 186 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  71.27 
 
 		 186 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  71.27 
 
 		 186 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  63.13 
 
 		 214 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  63.04 
 
 		 191 aa  255  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  64.61 
 
 		 192 aa  255  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  62.76 
 
 		 213 aa  250  8.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  64.25 
 
 		 192 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  63.69 
 
 		 192 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  62.98 
 
 		 190 aa  249  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  62.57 
 
 		 194 aa  249  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  62.57 
 
 		 194 aa  248  6e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 185 aa  246  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 193 aa  229  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  61.96 
 
 		 178 aa  222  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  57.3 
 
 		 187 aa  219  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  60.96 
 
 		 198 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  49.73 
 
 		 191 aa  209  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3836  hypothetical protein  51.4 
 
 		 181 aa  198  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.902876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  48 
 
 		 183 aa  187  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1229  hypothetical protein  48.07 
 
 		 187 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4796  transcriptional regulators-like protein  43.1 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5338  transcriptional regulators-like protein  43.1 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5453  transcriptional regulators-like protein  43.1 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0198  transcriptional regulators-like  43.1 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5408  transcriptional regulators-like  43.1 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4816  transcriptional regulators-like protein  43.1 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912627  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1942  transcriptional regulator-like protein  42.86 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  41.95 
 
 		 181 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  43.1 
 
 		 186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  42.2 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  44.25 
 
 		 174 aa  153  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1483  putative transcriptional regulator  42.04 
 
 		 174 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  39.18 
 
 		 189 aa  141  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  39.66 
 
 		 186 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  38.98 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  38.98 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  40.6 
 
 		 166 aa  109  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  39.53 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  36.69 
 
 		 175 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  32.37 
 
 		 167 aa  94.7  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  33.08 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4210  regulatory protein, ArsR  27.44 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.204887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  29.06 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1167  transcription regulator  26.62 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.25103  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2178  hypothetical protein  29.51 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  30.72 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1298  regulatory protein ArsR  23.78 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3460  transcriptional regulator protein-like protein  43.28 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  31.94 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 145 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2636  hypothetical protein  29.41 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2690  hypothetical protein  29.41 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  25.51 
 
 		 189 aa  52  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  27.78 
 
 		 169 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  34.15 
 
 		 158 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  31.65 
 
 		 171 aa  48.1  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  27.61 
 
 		 157 aa  45.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  27.14 
 
 		 169 aa  45.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  32.56 
 
 		 163 aa  45.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  32.56 
 
 		 155 aa  45.1  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  27.94 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2135  hypothetical protein  31.58 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.421336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2057  YuaC  20.33 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000122085  hitchhiker  0.000000369916 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1001  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 152 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1045  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 152 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.734934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>