66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2057 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2057  YuaC  100 
 
 		 183 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000122085  hitchhiker  0.000000369916 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  43.35 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  42.17 
 
 		 189 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2178  hypothetical protein  42.61 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1475  YuaC  41.04 
 
 		 180 aa  121  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.472023  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2690  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2636  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1167  transcription regulator  34.48 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.25103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  28 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  26.58 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  34.13 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  32.54 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1298  regulatory protein ArsR  31.68 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  25.71 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  25.35 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  25.35 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4210  regulatory protein, ArsR  27.1 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.204887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  25 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0868  hypothetical protein  27.06 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  25.71 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  25.71 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  25.71 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  22.78 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  26.02 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  26.02 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  22.78 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  22.78 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  21.95 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  24.49 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  23.64 
 
 		 180 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4796  transcriptional regulators-like protein  24.27 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5338  transcriptional regulators-like protein  24.27 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5453  transcriptional regulators-like protein  24.75 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5408  transcriptional regulators-like  24.75 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4816  transcriptional regulators-like protein  24.75 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912627  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  28.87 
 
 		 175 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0198  transcriptional regulators-like  24.75 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  30.56 
 
 		 155 aa  48.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  30.56 
 
 		 163 aa  48.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 145 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  31.11 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  21.05 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  20 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  21.1 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  27.78 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  24.04 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1483  putative transcriptional regulator  21.1 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  18.37 
 
 		 191 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  27.78 
 
 		 192 aa  44.3  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  24.21 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  21.62 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  21.48 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  20.33 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  26.32 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1942  transcriptional regulator-like protein  19.27 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  36.51 
 
 		 160 aa  42  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  22.58 
 
 		 217 aa  42  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  20.97 
 
 		 174 aa  41.6  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  29.73 
 
 		 168 aa  41.6  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3460  transcriptional regulator protein-like protein  28.89 
 
 		 198 aa  41.2  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>