71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3210 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  390  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2057  YuaC  42.17 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000122085  hitchhiker  0.000000369916 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  38.69 
 
 		 178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1475  YuaC  40 
 
 		 180 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.472023  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2690  hypothetical protein  38.29 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2636  hypothetical protein  38.29 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2178  hypothetical protein  38.24 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  24.84 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1167  transcription regulator  25.43 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.25103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  33.72 
 
 		 171 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  29 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1298  regulatory protein ArsR  29.17 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  29.59 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  30.61 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  30.61 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  24.44 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  27.78 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4210  regulatory protein, ArsR  21.19 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.204887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  20.57 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  22.45 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  20.57 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1483  putative transcriptional regulator  22.45 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  28.57 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  26.53 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  22.45 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  22.45 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  41.33 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  26.43 
 
 		 168 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  25.51 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  20.77 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  32.43 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  27.45 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  25.51 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  26.53 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  40 
 
 		 153 aa  51.6  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  21.74 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  35.14 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  26.53 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  24.76 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  25.74 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  25.74 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0198  transcriptional regulators-like  22.92 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5408  transcriptional regulators-like  22.92 
 
 		 177 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  23.16 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5453  transcriptional regulators-like protein  22.92 
 
 		 177 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4816  transcriptional regulators-like protein  22.92 
 
 		 177 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912627  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5338  transcriptional regulators-like protein  22.92 
 
 		 177 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4796  transcriptional regulators-like protein  22.92 
 
 		 177 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1942  transcriptional regulator-like protein  19.15 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  30.68 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  24.39 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  22.88 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  23.4 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  24.79 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  24.49 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  28.41 
 
 		 155 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  27.7 
 
 		 160 aa  46.2  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3836  hypothetical protein  25 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.902876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  21.51 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  27.96 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  22.11 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  23.47 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  27.96 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  27.96 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  18.92 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  26.44 
 
 		 152 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  25.93 
 
 		 150 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 193 aa  42  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3460  transcriptional regulator protein-like protein  24.36 
 
 		 198 aa  41.2  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>