50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2203 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  296  7e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  56.94 
 
 		 193 aa  163  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  53.79 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  48.59 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  47.48 
 
 		 172 aa  127  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  48.2 
 
 		 232 aa  118  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  43.84 
 
 		 161 aa  113  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  46.58 
 
 		 156 aa  110  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  40 
 
 		 169 aa  103  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  44.22 
 
 		 237 aa  100  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  44.7 
 
 		 316 aa  98.6  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  43.36 
 
 		 152 aa  97.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  41.26 
 
 		 239 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  40.15 
 
 		 159 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  40.15 
 
 		 159 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  40.15 
 
 		 159 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  41.61 
 
 		 241 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  38.62 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  39.69 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0501  transcriptional regulator, MarR family  36.69 
 
 		 253 aa  70.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5015  hypothetical protein  35.57 
 
 		 244 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  35 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  36.43 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  29.17 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  29.93 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  30.56 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  27.86 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  28.7 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  25.69 
 
 		 156 aa  50.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  28.57 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  38.82 
 
 		 175 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02225  hypothetical protein  25.71 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.479286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  23.93 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  30.41 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  27.86 
 
 		 163 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  35.16 
 
 		 214 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  29.6 
 
 		 174 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  31.76 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  32.93 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  25.93 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  32.93 
 
 		 192 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  31.71 
 
 		 192 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  34.83 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  34.15 
 
 		 194 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  32.93 
 
 		 190 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  32.58 
 
 		 186 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  32.22 
 
 		 186 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  32.58 
 
 		 186 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  32.93 
 
 		 213 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>