36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5169 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 152 aa  302  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  36.36 
 
 		 152 aa  113  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  39.57 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  38.3 
 
 		 160 aa  100  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  41.1 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  32.14 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  35.61 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  31.39 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  35.92 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  27.54 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  27.21 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  31.01 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  31.01 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  31.01 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  30.88 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  28.12 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  33.1 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  34.88 
 
 		 179 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  29.32 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  24.31 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  31.25 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  29.63 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  28.47 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  30.22 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  27.14 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  29.66 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  27.86 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  22.63 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  22.63 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  24.11 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 251 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  25 
 
 		 316 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0501  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 253 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  26.4 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 268 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  34.15 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>