52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5388 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  343  7e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  52.52 
 
 		 155 aa  145  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  47.48 
 
 		 193 aa  136  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  45.83 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  47.48 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  39.87 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  41.26 
 
 		 161 aa  110  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  43.18 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  43.18 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  43.18 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  38.62 
 
 		 239 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  40.56 
 
 		 232 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  43.41 
 
 		 316 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  37.68 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  42.96 
 
 		 241 aa  97.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  36.81 
 
 		 153 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 		 237 aa  95.5  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  41.1 
 
 		 158 aa  94.7  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0501  transcriptional regulator, MarR family  38.62 
 
 		 253 aa  92  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  39.01 
 
 		 251 aa  90.9  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  41.3 
 
 		 156 aa  90.9  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5015  hypothetical protein  40.43 
 
 		 244 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  33.1 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  32.41 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  25.35 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  38.58 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  27.54 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  25.85 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  27.27 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02225  hypothetical protein  28.1 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.479286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  29.58 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  25.98 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  26.21 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  27.89 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  28.1 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  26.8 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  25.69 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  30.95 
 
 		 155 aa  52.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  26.9 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  25.68 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  24.5 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  41.82 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  28.09 
 
 		 191 aa  45.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  28.42 
 
 		 166 aa  44.3  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  28.97 
 
 		 180 aa  44.3  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  30.34 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  29.21 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2074  transcriptional regulator, TrmB  26.74 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0492265  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  24.64 
 
 		 175 aa  42  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 187 aa  42  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  29.21 
 
 		 190 aa  41.2  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  45.24 
 
 		 214 aa  40.8  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>