40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2074 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2074  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 127 aa  259  1e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0492265  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1397  transcriptional regulator, TrmB  60.63 
 
 		 131 aa  156  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000176396 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0278  transcriptional regulator, TrmB  34.43 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2027  transcriptional regulator, TrmB  39.77 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1566  transcriptional regulator, TrmB  37.96 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.449969  normal  0.0696439 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1032  transcriptional regulator, TrmB  35.83 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.325254  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2081  transcriptional regulator, TrmB  35.19 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2175  transcriptional regulator, TrmB  29.79 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2275  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 237 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171437  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  26.25 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  27.72 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2084  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  27.72 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1438  transcriptional regulator, TrmB  32.61 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0728  transcriptional regulator, TrmB  29.51 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.22819  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1436  transcriptional regulator, TrmB  31.17 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0541  ROK family protein  33.33 
 
 		 371 aa  43.5  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0625094  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  26.74 
 
 		 172 aa  42.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0425  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.973468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0414  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1715  ROK family protein  35 
 
 		 425 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.853629  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2097  transcriptional regulator TrmB  36.21 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  32.1 
 
 		 388 aa  42  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 160 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0527  ROK family protein  31.88 
 
 		 371 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  29.23 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1356  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 248 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 157 aa  41.2  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 158 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0154  adc operon repressor AdcR  31.25 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  34.69 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32910  transcriptional regulator/sugar kinase  38.6 
 
 		 400 aa  41.2  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235985  normal  0.423272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 237 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 183 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  42.86 
 
 		 239 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 174 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>