23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2097 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2097  transcriptional regulator TrmB  100 
 
 		 124 aa  255  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2144  transcriptional regulator, TrmB  36.67 
 
 		 134 aa  97.4  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0817  transcriptional regulator, TrmB  35.2 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3632  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 133 aa  93.6  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3986  transcriptional regulator, TrmB  34.45 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.958939  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4295  transcriptional regulator, TrmB  32.77 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0014  transcriptional regulator, TrmB  39.39 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.682046  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3390  transcriptional regulator, TrmB  31.3 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0728  transcriptional regulator, TrmB  37.76 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.22819  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0154  transcriptional regulator, TrmB  39 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.487715  normal  0.0526976 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1748  transcriptional regulator, TrmB  39 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0714  transcriptional regulator, TrmB  38 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2705  transcriptional regulator, TrmB  34.29 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0320  transcriptional regulator, TrmB  31.53 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0781  transcriptional regulator, TrmB  31.07 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.44791 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0146  transcriptional regulator, TrmB  32.38 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1080  hypothetical protein  27.27 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1935  transcriptional regulator, TrmB  20.95 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1140  hypothetical protein  30.21 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2081  transcriptional regulator, TrmB  33.8 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2742  transcriptional regulator, TrmB  24.68 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2074  transcriptional regulator, TrmB  36.21 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0492265  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 153 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>