24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0728 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0728  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 
130 aa  268  2e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.22819  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0014  transcriptional regulator, TrmB  60 
 
 
130 aa  174  5e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.682046  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0154  transcriptional regulator, TrmB  56.92 
 
 
130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.487715  normal  0.0526976 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0714  transcriptional regulator, TrmB  56.92 
 
 
130 aa  160  6e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1748  transcriptional regulator, TrmB  56.15 
 
 
130 aa  159  9e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2705  transcriptional regulator, TrmB  34.26 
 
 
125 aa  89  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0781  transcriptional regulator, TrmB  33.65 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.44791 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0320  transcriptional regulator, TrmB  31.48 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2097  transcriptional regulator TrmB  37.76 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0146  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3986  transcriptional regulator, TrmB  25.95 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.958939  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0817  transcriptional regulator, TrmB  29.35 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3632  transcriptional regulator, TrmB  24.78 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4295  transcriptional regulator, TrmB  24.17 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3390  transcriptional regulator, TrmB  32.61 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2144  transcriptional regulator, TrmB  27.84 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1935  transcriptional regulator, TrmB  25.44 
 
 
172 aa  57.4  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1080  hypothetical protein  27.97 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1140  hypothetical protein  30 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0847  transcriptional regulator, TrmB  20.18 
 
 
205 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2742  transcriptional regulator, TrmB  27.05 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2074  transcriptional regulator, TrmB  29.51 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0492265  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2081  transcriptional regulator, TrmB  29.21 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  27.37 
 
 
153 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>