25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3632 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3632  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 
133 aa  278  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3986  transcriptional regulator, TrmB  85.19 
 
 
135 aa  243  8e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.958939  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4295  transcriptional regulator, TrmB  82.96 
 
 
135 aa  238  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2144  transcriptional regulator, TrmB  76.69 
 
 
134 aa  224  4e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3390  transcriptional regulator, TrmB  73.23 
 
 
130 aa  209  9e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0817  transcriptional regulator, TrmB  69.4 
 
 
134 aa  205  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2097  transcriptional regulator TrmB  35.29 
 
 
124 aa  93.6  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0714  transcriptional regulator, TrmB  31.09 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0154  transcriptional regulator, TrmB  30.25 
 
 
130 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.487715  normal  0.0526976 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1748  transcriptional regulator, TrmB  30.25 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0728  transcriptional regulator, TrmB  24.78 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.22819  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0014  transcriptional regulator, TrmB  27.97 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.682046  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0146  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0320  transcriptional regulator, TrmB  26.36 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0781  transcriptional regulator, TrmB  26.73 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.44791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1080  hypothetical protein  23.42 
 
 
119 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2705  transcriptional regulator, TrmB  25.24 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0847  transcriptional regulator, TrmB  27.16 
 
 
205 aa  45.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1935  transcriptional regulator, TrmB  26.44 
 
 
172 aa  44.3  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  35.82 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1817  transcriptional regulator, TrmB  25.69 
 
 
133 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2175  transcriptional regulator, TrmB  22.68 
 
 
115 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1140  hypothetical protein  20.18 
 
 
115 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2742  transcriptional regulator, TrmB  22.12 
 
 
179 aa  40.8  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  43.24 
 
 
254 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>