23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0014 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0014  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 130 aa  266  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.682046  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0154  transcriptional regulator, TrmB  73.85 
 
 		 130 aa  207  4e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.487715  normal  0.0526976 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1748  transcriptional regulator, TrmB  73.08 
 
 		 130 aa  206  9e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0714  transcriptional regulator, TrmB  73.85 
 
 		 130 aa  206  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0728  transcriptional regulator, TrmB  60 
 
 		 130 aa  174  5e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.22819  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0320  transcriptional regulator, TrmB  36.61 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0781  transcriptional regulator, TrmB  36.89 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.44791 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2097  transcriptional regulator TrmB  39.39 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2705  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0817  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 134 aa  76.6  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2144  transcriptional regulator, TrmB  27.97 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4295  transcriptional regulator, TrmB  27.97 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3632  transcriptional regulator, TrmB  27.97 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3390  transcriptional regulator, TrmB  26.5 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0146  transcriptional regulator, TrmB  34.88 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3986  transcriptional regulator, TrmB  27.12 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.958939  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1140  hypothetical protein  30.56 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1080  hypothetical protein  29.52 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0847  transcriptional regulator, TrmB  25.44 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2742  transcriptional regulator, TrmB  24.51 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  26.96 
 
 		 151 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  26.96 
 
 		 151 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>