17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2742 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2742  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 179 aa  358  2e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1935  transcriptional regulator, TrmB  41.61 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0847  transcriptional regulator, TrmB  29.33 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0320  transcriptional regulator, TrmB  37.38 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0781  transcriptional regulator, TrmB  42.31 
 
 		 123 aa  57.4  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.44791 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2705  transcriptional regulator, TrmB  35.42 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0728  transcriptional regulator, TrmB  27.05 
 
 		 130 aa  50.1  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.22819  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2081  transcriptional regulator, TrmB  35.14 
 
 		 125 aa  48.9  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0817  transcriptional regulator, TrmB  25.64 
 
 		 134 aa  46.2  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1566  transcriptional regulator, TrmB  28.21 
 
 		 128 aa  43.5  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.449969  normal  0.0696439 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0146  transcriptional regulator, TrmB  25.62 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1748  transcriptional regulator, TrmB  23.58 
 
 		 130 aa  42.4  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2097  transcriptional regulator TrmB  24.68 
 
 		 124 aa  42.4  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0014  transcriptional regulator, TrmB  24.51 
 
 		 130 aa  42.4  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.682046  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0714  transcriptional regulator, TrmB  23.58 
 
 		 130 aa  42  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0154  transcriptional regulator, TrmB  23.58 
 
 		 130 aa  41.6  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.487715  normal  0.0526976 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3632  transcriptional regulator, TrmB  22.12 
 
 		 133 aa  40.8  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>