20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1566 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1566  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 128 aa  259  8.999999999999999e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.449969  normal  0.0696439 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2081  transcriptional regulator, TrmB  69.92 
 
 		 125 aa  188  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1032  transcriptional regulator, TrmB  48.72 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.325254  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2027  transcriptional regulator, TrmB  44.26 
 
 		 132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71946  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2074  transcriptional regulator, TrmB  37.96 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0492265  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1563  transcriptional regulator, TrmB  40.43 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.223033  normal  0.067732 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1397  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000176396 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2084  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0278  transcriptional regulator, TrmB  35 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2175  transcriptional regulator, TrmB  30.1 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  27.84 
 
 		 259 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2742  transcriptional regulator, TrmB  28.21 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1048  Fis family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 287 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3246  ROK family protein  39.06 
 
 		 304 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1935  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  31.94 
 
 		 280 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  32.91 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 161 aa  40  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>