15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2084 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2084  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 111 aa  221  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1563  transcriptional regulator, TrmB  64.15 
 
 		 115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.223033  normal  0.067732 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1566  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.449969  normal  0.0696439 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1032  transcriptional regulator, TrmB  41.84 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.325254  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2027  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71946  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2081  transcriptional regulator, TrmB  36.45 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1397  transcriptional regulator, TrmB  39.74 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000176396 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1438  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0146  transcriptional regulator, TrmB  40.98 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2074  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0492265  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2175  transcriptional regulator, TrmB  30.86 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0027  hypothetical protein  39.13 
 
 		 325 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242555  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1436  transcriptional regulator, TrmB  31.11 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  29.33 
 
 		 415 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2427  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.46 
 
 		 321 aa  40  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>