17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1048 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1048  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 287 aa  569  1e-161  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0933  hypothetical protein  57.59 
 
 		 290 aa  260  2e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.846552  hitchhiker  0.0043077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0020  hypothetical protein  59.31 
 
 		 290 aa  257  1e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0833  hypothetical protein  65.49 
 
 		 213 aa  165  9e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1374  hypothetical protein  42.71 
 
 		 169 aa  125  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508752  normal  0.0176648 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1547  hypothetical protein  72.73 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1776  transcriptional regulator, TrmB  25.87 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0136034  normal  0.0115513 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0572  solute binding protein-like protein  36.99 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0198  transcriptional regulator, TrmB  27.96 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.613545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1260  hypothetical protein  40.32 
 
 		 274 aa  50.4  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0725  transcriptional regulator, TrmB  36.21 
 
 		 117 aa  50.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.872668 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2298  transcriptional regulator, TrmB  34.33 
 
 		 118 aa  49.3  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00618378 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1250  transcriptional regulator, TrmB  26.75 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.727025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1111  hypothetical protein  32.81 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1940  transcriptional regulator, TrmB  32.35 
 
 		 116 aa  47.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.600204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2070  transcriptional regulator, TrmB  35.38 
 
 		 114 aa  47  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1111  type IV secretion system protein VirD4  32.98 
 
 		 509 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>