18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1250 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1250  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 310 aa  616  1e-175  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.727025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0198  transcriptional regulator, TrmB  63.06 
 
 		 305 aa  340  1e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.613545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1776  transcriptional regulator, TrmB  42.44 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0136034  normal  0.0115513 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0346  transcriptional regulator, TrmB  47.69 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1111  hypothetical protein  44.78 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0725  transcriptional regulator, TrmB  40.98 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.872668 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1940  transcriptional regulator, TrmB  40.68 
 
 		 116 aa  53.1  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.600204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1485  hypothetical protein  40.68 
 
 		 172 aa  52.4  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.563194  normal  0.242902 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2298  transcriptional regulator, TrmB  38.98 
 
 		 118 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00618378 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0561  hypothetical protein  42.86 
 
 		 157 aa  49.3  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2070  transcriptional regulator, TrmB  38.98 
 
 		 114 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0572  solute binding protein-like protein  36.92 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1260  hypothetical protein  45.1 
 
 		 274 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0181  transcriptional regulator, TrmB  37.74 
 
 		 140 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.152523 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0732  hypothetical protein  42.86 
 
 		 163 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000258314 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1048  Fis family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1374  hypothetical protein  34.25 
 
 		 169 aa  42.7  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508752  normal  0.0176648 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0034  hypothetical protein  34.55 
 
 		 335 aa  42.7  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>