23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2298 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2298  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 118 aa  229  1e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00618378 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1940  transcriptional regulator, TrmB  69.49 
 
 		 116 aa  161  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.600204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2070  transcriptional regulator, TrmB  65.25 
 
 		 114 aa  151  4e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0725  transcriptional regulator, TrmB  63 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.872668 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0346  transcriptional regulator, TrmB  52.54 
 
 		 313 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1776  transcriptional regulator, TrmB  48.28 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0136034  normal  0.0115513 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0291  hypothetical protein  41.38 
 
 		 327 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0198  transcriptional regulator, TrmB  38.71 
 
 		 305 aa  52.8  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.613545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0181  transcriptional regulator, TrmB  43.86 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.152523 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1250  transcriptional regulator, TrmB  38.98 
 
 		 310 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.727025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0034  hypothetical protein  35.62 
 
 		 335 aa  50.8  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0933  hypothetical protein  44.64 
 
 		 290 aa  50.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.846552  hitchhiker  0.0043077 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1048  Fis family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 287 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1374  hypothetical protein  32.84 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508752  normal  0.0176648 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1547  hypothetical protein  35.71 
 
 		 246 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0020  hypothetical protein  40.74 
 
 		 290 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4608  IclR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 255 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0496  regulatory protein, IclR  40.68 
 
 		 287 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0572  solute binding protein-like protein  32.81 
 
 		 344 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1485  hypothetical protein  34.85 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.563194  normal  0.242902 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  46 
 
 		 285 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2448  hypothetical protein  36.36 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5126  transcriptional regulator, IclR family  38.67 
 
 		 255 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>