17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1547 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1547  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  485  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0833  hypothetical protein  94.81 
 
 		 213 aa  250  2e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1048  Fis family transcriptional regulator  64.55 
 
 		 287 aa  138  6e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1374  hypothetical protein  44.97 
 
 		 169 aa  115  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508752  normal  0.0176648 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0933  hypothetical protein  70.59 
 
 		 290 aa  107  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.846552  hitchhiker  0.0043077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0020  hypothetical protein  72.31 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1776  transcriptional regulator, TrmB  26.32 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0136034  normal  0.0115513 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1940  transcriptional regulator, TrmB  40.35 
 
 		 116 aa  51.2  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.600204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1260  hypothetical protein  43.1 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0572  solute binding protein-like protein  38.1 
 
 		 344 aa  49.7  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1111  hypothetical protein  34 
 
 		 303 aa  49.3  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0725  transcriptional regulator, TrmB  36.84 
 
 		 117 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.872668 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2070  transcriptional regulator, TrmB  34.04 
 
 		 114 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2298  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 		 118 aa  46.2  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00618378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0291  hypothetical protein  23.4 
 
 		 327 aa  46.2  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0198  transcriptional regulator, TrmB  36.67 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.613545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1250  transcriptional regulator, TrmB  33.82 
 
 		 310 aa  42.4  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.727025  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>