20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1776 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1776  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 307 aa  608  1e-173  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0136034  normal  0.0115513 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1250  transcriptional regulator, TrmB  42.77 
 
 		 310 aa  219  6e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.727025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0198  transcriptional regulator, TrmB  42.22 
 
 		 305 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.613545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0346  transcriptional regulator, TrmB  61.83 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0725  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 117 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.872668 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2298  transcriptional regulator, TrmB  48.28 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00618378 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1940  transcriptional regulator, TrmB  43.75 
 
 		 116 aa  58.9  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.600204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1111  hypothetical protein  42.86 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2070  transcriptional regulator, TrmB  49.06 
 
 		 114 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0020  hypothetical protein  32 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0291  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0181  transcriptional regulator, TrmB  29.41 
 
 		 140 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.152523 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0034  hypothetical protein  36.36 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1485  hypothetical protein  37.5 
 
 		 172 aa  46.6  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.563194  normal  0.242902 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0933  hypothetical protein  34.38 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.846552  hitchhiker  0.0043077 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1547  hypothetical protein  32.35 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0833  hypothetical protein  38.46 
 
 		 213 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1374  hypothetical protein  36.99 
 
 		 169 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508752  normal  0.0176648 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1260  hypothetical protein  39.39 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0561  hypothetical protein  29.67 
 
 		 157 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>