15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1111 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1111  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  595  1e-169  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0034  hypothetical protein  22.33 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0346  transcriptional regulator, TrmB  48.39 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1250  transcriptional regulator, TrmB  44.78 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.727025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1776  transcriptional regulator, TrmB  42.67 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0136034  normal  0.0115513 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0572  solute binding protein-like protein  37.5 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1260  hypothetical protein  47.22 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0198  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.613545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1374  hypothetical protein  37.66 
 
 		 169 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508752  normal  0.0176648 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0933  hypothetical protein  36.92 
 
 		 290 aa  46.2  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.846552  hitchhiker  0.0043077 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1048  Fis family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0020  hypothetical protein  37.5 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0725  transcriptional regulator, TrmB  35 
 
 		 117 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.872668 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2070  transcriptional regulator, TrmB  36.67 
 
 		 114 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0291  hypothetical protein  34.38 
 
 		 327 aa  42.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>