18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0198 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0198  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 305 aa  589  1e-167  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.613545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1250  transcriptional regulator, TrmB  63.06 
 
 		 310 aa  360  1e-98  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.727025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1776  transcriptional regulator, TrmB  42.51 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0136034  normal  0.0115513 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0346  transcriptional regulator, TrmB  48.25 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1111  hypothetical protein  40.91 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0725  transcriptional regulator, TrmB  44.26 
 
 		 117 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.872668 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1940  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 116 aa  54.7  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.600204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1260  hypothetical protein  49.21 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2298  transcriptional regulator, TrmB  38.71 
 
 		 118 aa  53.1  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00618378 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1485  hypothetical protein  43.64 
 
 		 172 aa  52.4  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.563194  normal  0.242902 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0181  transcriptional regulator, TrmB  39.62 
 
 		 140 aa  49.7  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.152523 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2070  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 114 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1547  hypothetical protein  37.14 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0034  hypothetical protein  35.71 
 
 		 335 aa  47  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0561  hypothetical protein  41.07 
 
 		 157 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1374  hypothetical protein  35.14 
 
 		 169 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508752  normal  0.0176648 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0732  hypothetical protein  42.86 
 
 		 163 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000258314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  51.06 
 
 		 266 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>