34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0725 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0725  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 117 aa  230  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.872668 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1940  transcriptional regulator, TrmB  65.52 
 
 		 116 aa  154  4e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.600204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2298  transcriptional regulator, TrmB  61.21 
 
 		 118 aa  143  6e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00618378 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2070  transcriptional regulator, TrmB  63.48 
 
 		 114 aa  143  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0346  transcriptional regulator, TrmB  55.93 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1776  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0136034  normal  0.0115513 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0181  transcriptional regulator, TrmB  29.27 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.152523 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0198  transcriptional regulator, TrmB  44.26 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.613545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0291  hypothetical protein  33.94 
 
 		 327 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1250  transcriptional regulator, TrmB  40.98 
 
 		 310 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.727025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1374  hypothetical protein  35.09 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508752  normal  0.0176648 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1048  Fis family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 287 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1547  hypothetical protein  36.84 
 
 		 246 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0933  hypothetical protein  40.35 
 
 		 290 aa  47.8  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.846552  hitchhiker  0.0043077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0020  hypothetical protein  40.74 
 
 		 290 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0034  hypothetical protein  33.9 
 
 		 335 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1111  hypothetical protein  35 
 
 		 303 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4608  IclR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 255 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1485  hypothetical protein  33.72 
 
 		 172 aa  43.9  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.563194  normal  0.242902 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1260  hypothetical protein  38.98 
 
 		 274 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  48 
 
 		 285 aa  41.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2448  hypothetical protein  35 
 
 		 185 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0819  hypothetical protein  35.14 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 291 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1190  transcriptional regulator, TrmB  39.66 
 
 		 284 aa  40.8  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.280111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  45.24 
 
 		 259 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0496  regulatory protein, IclR  36.23 
 
 		 287 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  42.31 
 
 		 255 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  45.1 
 
 		 254 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0168  transcriptional repressor CodY  29.9 
 
 		 262 aa  40  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000303115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5126  transcriptional regulator, IclR family  45.28 
 
 		 255 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2797  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 254 aa  40  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>