16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1260 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1260  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  523  1e-147  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1111  hypothetical protein  47.54 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0346  transcriptional regulator, TrmB  56.6 
 
 		 313 aa  52.8  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1547  hypothetical protein  38.89 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0198  transcriptional regulator, TrmB  50.98 
 
 		 305 aa  49.7  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.613545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0933  hypothetical protein  44.07 
 
 		 290 aa  49.7  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.846552  hitchhiker  0.0043077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0020  hypothetical protein  50 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1048  Fis family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1374  hypothetical protein  40.54 
 
 		 169 aa  47  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508752  normal  0.0176648 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1250  transcriptional regulator, TrmB  45.1 
 
 		 310 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.727025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0572  solute binding protein-like protein  37.74 
 
 		 344 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1776  transcriptional regulator, TrmB  43.4 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0136034  normal  0.0115513 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1940  transcriptional regulator, TrmB  40.68 
 
 		 116 aa  43.9  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.600204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2070  transcriptional regulator, TrmB  37.7 
 
 		 114 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0725  transcriptional regulator, TrmB  38.98 
 
 		 117 aa  42.7  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.872668 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0034  hypothetical protein  36 
 
 		 335 aa  42.7  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>