25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1940 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1940  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 116 aa  225  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.600204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2298  transcriptional regulator, TrmB  69.49 
 
 		 118 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00618378 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2070  transcriptional regulator, TrmB  69.83 
 
 		 114 aa  159  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0725  transcriptional regulator, TrmB  67.96 
 
 		 117 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.872668 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0346  transcriptional regulator, TrmB  50.85 
 
 		 313 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0291  hypothetical protein  38.32 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1776  transcriptional regulator, TrmB  43.75 
 
 		 307 aa  58.2  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0136034  normal  0.0115513 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0198  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 305 aa  53.9  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.613545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0181  transcriptional regulator, TrmB  40.28 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.152523 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1485  hypothetical protein  35.25 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.563194  normal  0.242902 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1250  transcriptional regulator, TrmB  40.68 
 
 		 310 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.727025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1547  hypothetical protein  40.35 
 
 		 246 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0933  hypothetical protein  41.18 
 
 		 290 aa  50.8  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.846552  hitchhiker  0.0043077 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0034  hypothetical protein  34.29 
 
 		 335 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1374  hypothetical protein  38.18 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508752  normal  0.0176648 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1048  Fis family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 287 aa  47  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0020  hypothetical protein  40 
 
 		 290 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1260  hypothetical protein  40.68 
 
 		 274 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2448  hypothetical protein  34.12 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1111  hypothetical protein  33.85 
 
 		 303 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4608  IclR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 255 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0332  hypothetical protein  30.77 
 
 		 378 aa  41.2  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0572  solute binding protein-like protein  32.26 
 
 		 344 aa  41.2  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  42.42 
 
 		 285 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3237  regulatory protein GntR HTH  36.76 
 
 		 184 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00899856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>