17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2448 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2448  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  369  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2189  hypothetical protein  38.92 
 
 
188 aa  107  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1520  hypothetical protein  31.44 
 
 
197 aa  101  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3237  regulatory protein GntR HTH  37.91 
 
 
184 aa  96.3  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00899856  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1199  hypothetical protein  30.19 
 
 
181 aa  52  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1918  hypothetical protein  33.77 
 
 
263 aa  44.3  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0584  transcriptional regulator, TrmB  29.46 
 
 
355 aa  44.3  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000506573  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0365  hypothetical protein  20.71 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.260596  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1940  transcriptional regulator, TrmB  34.12 
 
 
116 aa  43.5  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.600204  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1865  hypothetical protein  33.33 
 
 
640 aa  42.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1547  hypothetical protein  20.3 
 
 
206 aa  42.4  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0292935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0882  transcriptional regulator, DeoR family  35.59 
 
 
277 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.262564  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1080  hypothetical protein  20.62 
 
 
207 aa  42.4  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1381  hypothetical protein  30.91 
 
 
434 aa  42  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.639137  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0725  transcriptional regulator, TrmB  35 
 
 
117 aa  41.6  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.872668 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0388  hypothetical protein  38.33 
 
 
435 aa  41.2  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3289  hypothetical protein  30.56 
 
 
261 aa  41.2  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>