26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0388 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0388  hypothetical protein  100 
 
 
435 aa  851    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3340  hypothetical protein  34.41 
 
 
425 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1381  hypothetical protein  31.28 
 
 
434 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.639137  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1427  hypothetical protein  33.64 
 
 
444 aa  153  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1271  hypothetical protein  34.45 
 
 
380 aa  149  8e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.486206 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2548  hypothetical protein  30.81 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.140695 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0766  hypothetical protein  27.84 
 
 
440 aa  108  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305198  normal  0.716911 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3612  hypothetical protein  30.14 
 
 
388 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0464  hypothetical protein  31.14 
 
 
465 aa  87.4  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00621297  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2512  membrane protein  30.41 
 
 
406 aa  86.7  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0291  hypothetical protein  28.57 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2437  hypothetical protein  55.06 
 
 
469 aa  84.3  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813144  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3289  hypothetical protein  48.39 
 
 
261 aa  82.8  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1765  hypothetical protein  25.9 
 
 
443 aa  78.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569122  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3002  Uncharacterized membrane-associated protein/domain-like protein  53.23 
 
 
248 aa  79  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5171  Uncharacterized membrane-associated protein/domain-like protein  54.84 
 
 
168 aa  78.2  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1865  hypothetical protein  46.43 
 
 
640 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1142  hypothetical protein  50.79 
 
 
216 aa  61.6  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2831  hypothetical protein  40.35 
 
 
202 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1085  hypothetical protein  36 
 
 
290 aa  55.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1896  hypothetical protein  35.71 
 
 
330 aa  50.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1918  hypothetical protein  36.76 
 
 
263 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2531  hypothetical protein  30 
 
 
318 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000779725  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1421  hypothetical protein  30 
 
 
128 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3314  hypothetical protein  27.73 
 
 
453 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0908222 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1199  hypothetical protein  35.38 
 
 
181 aa  44.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>