14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1080 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1080  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0365  hypothetical protein  92.72 
 
 		 207 aa  384  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.260596  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1547  hypothetical protein  91.75 
 
 		 206 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0292935 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1681  transcriptional regulator, TrmB  68.06 
 
 		 215 aa  284  7e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1819  hypothetical protein  26.02 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1236  regulatory protein, MarR  34.25 
 
 		 453 aa  51.6  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149898  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1389  hypothetical protein  34.67 
 
 		 453 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0508  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 453 aa  48.5  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.508311  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1400  regulatory protein MarR  30.14 
 
 		 452 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0822  hypothetical protein  38.81 
 
 		 529 aa  45.1  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3237  regulatory protein GntR HTH  36.76 
 
 		 184 aa  45.1  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00899856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0584  transcriptional regulator, TrmB  35.82 
 
 		 355 aa  42.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000506573  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2448  hypothetical protein  20.62 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 387 aa  42.4  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>