30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0508 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0508  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 453 aa  893    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.508311  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1400  regulatory protein MarR  88.74 
 
 		 452 aa  797    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1236  regulatory protein, MarR  89.62 
 
 		 453 aa  800    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149898  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1389  hypothetical protein  62 
 
 		 453 aa  542  1e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0822  hypothetical protein  34.97 
 
 		 529 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0464  hypothetical protein  47.62 
 
 		 465 aa  56.6  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00621297  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3002  Uncharacterized membrane-associated protein/domain-like protein  43.24 
 
 		 248 aa  54.7  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2512  membrane protein  46.77 
 
 		 406 aa  53.5  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1199  hypothetical protein  37.84 
 
 		 181 aa  51.6  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1681  transcriptional regulator, TrmB  35.62 
 
 		 215 aa  50.4  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3289  hypothetical protein  37.68 
 
 		 261 aa  50.1  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1865  hypothetical protein  38.2 
 
 		 640 aa  50.1  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1896  hypothetical protein  42.86 
 
 		 330 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1134  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 232 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1080  hypothetical protein  32.88 
 
 		 207 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1547  hypothetical protein  32.88 
 
 		 206 aa  47.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0292935 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1271  hypothetical protein  39.06 
 
 		 380 aa  47  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.486206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1819  hypothetical protein  37.5 
 
 		 202 aa  46.6  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1381  hypothetical protein  39.68 
 
 		 434 aa  46.6  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.639137  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5171  Uncharacterized membrane-associated protein/domain-like protein  37.66 
 
 		 168 aa  46.6  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1085  hypothetical protein  34.21 
 
 		 290 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1142  hypothetical protein  41.27 
 
 		 216 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0365  hypothetical protein  31.51 
 
 		 207 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.260596  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1340  regulatory protein MarR  35.09 
 
 		 299 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00576351  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  33.82 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 252 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1427  hypothetical protein  39.39 
 
 		 444 aa  44.3  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0903  hypothetical protein  32.2 
 
 		 462 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2531  hypothetical protein  40.98 
 
 		 318 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000779725  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  36.73 
 
 		 399 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>