28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1236 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1236  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 453 aa  897    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149898  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1400  regulatory protein MarR  86.09 
 
 		 452 aa  772    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0508  MarR family transcriptional regulator  89.62 
 
 		 453 aa  800    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.508311  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1389  hypothetical protein  62.44 
 
 		 453 aa  542  1e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0822  hypothetical protein  36.26 
 
 		 529 aa  241  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3002  Uncharacterized membrane-associated protein/domain-like protein  38.04 
 
 		 248 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1681  transcriptional regulator, TrmB  36.99 
 
 		 215 aa  53.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1547  hypothetical protein  31.78 
 
 		 206 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0292935 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0464  hypothetical protein  44.44 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00621297  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1199  hypothetical protein  40.54 
 
 		 181 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1080  hypothetical protein  34.25 
 
 		 207 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2512  membrane protein  45.16 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1134  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 232 aa  50.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1865  hypothetical protein  38.89 
 
 		 640 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0365  hypothetical protein  32.88 
 
 		 207 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.260596  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3289  hypothetical protein  36.23 
 
 		 261 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1340  regulatory protein MarR  38.6 
 
 		 299 aa  47  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00576351  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1819  hypothetical protein  37.5 
 
 		 202 aa  47  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1142  hypothetical protein  28.03 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1085  hypothetical protein  35.53 
 
 		 290 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1896  hypothetical protein  39.68 
 
 		 330 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0903  hypothetical protein  33.9 
 
 		 462 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  33.82 
 
 		 420 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0291  hypothetical protein  42.19 
 
 		 327 aa  43.5  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  38.78 
 
 		 399 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1271  hypothetical protein  37.5 
 
 		 380 aa  43.5  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.486206 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5171  Uncharacterized membrane-associated protein/domain-like protein  36.36 
 
 		 168 aa  43.1  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1381  hypothetical protein  38.1 
 
 		 434 aa  43.5  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.639137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>