14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1681 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1681  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 
215 aa  425  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1080  hypothetical protein  68.06 
 
 
207 aa  284  8e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0365  hypothetical protein  65.44 
 
 
207 aa  277  7e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.260596  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1547  hypothetical protein  64.06 
 
 
206 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0292935 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1236  regulatory protein, MarR  36.99 
 
 
453 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149898  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0508  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
453 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.508311  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1389  hypothetical protein  35.62 
 
 
453 aa  49.3  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1400  regulatory protein MarR  33.78 
 
 
452 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1819  hypothetical protein  23.27 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0671776  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0584  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 
355 aa  45.4  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000506573  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0822  hypothetical protein  40.85 
 
 
529 aa  43.5  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2531  hypothetical protein  31.43 
 
 
318 aa  42  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000779725  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 
154 aa  41.6  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  38.36 
 
 
387 aa  41.6  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>