25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2531 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2531  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  647    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000779725  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1085  hypothetical protein  36.99 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1918  hypothetical protein  35.96 
 
 
263 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3314  hypothetical protein  39.93 
 
 
453 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0908222 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1896  hypothetical protein  33.44 
 
 
330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1199  hypothetical protein  37.23 
 
 
181 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0464  hypothetical protein  39.71 
 
 
465 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00621297  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2512  membrane protein  39.71 
 
 
406 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1765  hypothetical protein  30.1 
 
 
443 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569122  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2548  hypothetical protein  35.94 
 
 
389 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.140695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1819  hypothetical protein  40 
 
 
202 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0671776  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1271  hypothetical protein  31.48 
 
 
380 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.486206 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0291  hypothetical protein  32.56 
 
 
327 aa  47.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5171  Uncharacterized membrane-associated protein/domain-like protein  39.66 
 
 
168 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2437  hypothetical protein  35.8 
 
 
469 aa  47.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813144  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1381  hypothetical protein  34.21 
 
 
434 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.639137  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0332  hypothetical protein  37.5 
 
 
378 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3612  hypothetical protein  32.35 
 
 
388 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1400  regulatory protein MarR  42.11 
 
 
452 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1389  hypothetical protein  40.62 
 
 
453 aa  44.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3002  Uncharacterized membrane-associated protein/domain-like protein  37.93 
 
 
248 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0388  hypothetical protein  29.85 
 
 
435 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0508  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
453 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.508311  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0766  hypothetical protein  25.56 
 
 
440 aa  43.5  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305198  normal  0.716911 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1142  hypothetical protein  33.33 
 
 
216 aa  43.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>