35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1819 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1819  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  403  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1199  hypothetical protein  52.41 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1547  hypothetical protein  26.67 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0292935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1896  hypothetical protein  34.45 
 
 		 330 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1918  hypothetical protein  33.65 
 
 		 263 aa  53.9  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3002  Uncharacterized membrane-associated protein/domain-like protein  46.55 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5171  Uncharacterized membrane-associated protein/domain-like protein  44.83 
 
 		 168 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1085  hypothetical protein  40.91 
 
 		 290 aa  52.8  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1142  hypothetical protein  40 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0365  hypothetical protein  26.02 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.260596  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3289  hypothetical protein  39.06 
 
 		 261 aa  51.6  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1080  hypothetical protein  26.02 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1400  regulatory protein MarR  38.89 
 
 		 452 aa  48.9  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1134  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 232 aa  48.9  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1520  hypothetical protein  25.67 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2548  hypothetical protein  30.39 
 
 		 389 aa  48.5  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.140695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2531  hypothetical protein  40 
 
 		 318 aa  48.5  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000779725  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0584  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 355 aa  48.5  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000506573  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1389  hypothetical protein  40.28 
 
 		 453 aa  48.1  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3314  hypothetical protein  40.62 
 
 		 453 aa  48.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0908222 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1681  transcriptional regulator, TrmB  23.27 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0332  hypothetical protein  32.47 
 
 		 378 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0508  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 453 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.508311  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1236  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 		 453 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149898  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3237  regulatory protein GntR HTH  40.68 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00899856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0464  hypothetical protein  41.38 
 
 		 465 aa  46.2  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00621297  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2512  membrane protein  41.38 
 
 		 406 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0291  hypothetical protein  39.06 
 
 		 327 aa  45.1  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1271  hypothetical protein  39.34 
 
 		 380 aa  43.5  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.486206 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2437  hypothetical protein  37.1 
 
 		 469 aa  43.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813144  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1381  hypothetical protein  31.96 
 
 		 434 aa  43.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.639137  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1485  hypothetical protein  33.77 
 
 		 172 aa  42.4  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.563194  normal  0.242902 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0822  hypothetical protein  39.24 
 
 		 529 aa  42.4  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0388  hypothetical protein  35.21 
 
 		 435 aa  41.6  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3340  hypothetical protein  30.34 
 
 		 425 aa  41.6  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>