16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1485 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1485  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  342  1e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.563194  normal  0.242902 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1940  transcriptional regulator, TrmB  34.82 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.600204  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1250  transcriptional regulator, TrmB  40.68 
 
 
310 aa  52.4  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.727025  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0198  transcriptional regulator, TrmB  43.64 
 
 
305 aa  52  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.613545  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0561  hypothetical protein  37.31 
 
 
157 aa  51.2  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0346  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 
313 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3289  hypothetical protein  32.95 
 
 
261 aa  48.5  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0034  hypothetical protein  31.15 
 
 
335 aa  48.1  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0732  hypothetical protein  34.29 
 
 
163 aa  47.8  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000258314 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1776  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 
307 aa  47  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0136034  normal  0.0115513 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0725  transcriptional regulator, TrmB  36.11 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.872668 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2070  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 
114 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1819  hypothetical protein  34.15 
 
 
202 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0671776  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1199  hypothetical protein  34.33 
 
 
181 aa  42  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1085  hypothetical protein  41.18 
 
 
290 aa  41.2  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2298  transcriptional regulator, TrmB  34.85 
 
 
118 aa  41.2  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00618378 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>