24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2070 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2070  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 114 aa  227  4e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1940  transcriptional regulator, TrmB  69.83 
 
 		 116 aa  159  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.600204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2298  transcriptional regulator, TrmB  65.25 
 
 		 118 aa  151  4e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00618378 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0725  transcriptional regulator, TrmB  65.69 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.872668 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0291  hypothetical protein  35 
 
 		 327 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0346  transcriptional regulator, TrmB  54.24 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0181  transcriptional regulator, TrmB  33.98 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.152523 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1776  transcriptional regulator, TrmB  49.06 
 
 		 307 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0136034  normal  0.0115513 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0034  hypothetical protein  38.81 
 
 		 335 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1374  hypothetical protein  38.46 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508752  normal  0.0176648 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0198  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 305 aa  48.5  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.613545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1547  hypothetical protein  40 
 
 		 246 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1250  transcriptional regulator, TrmB  38.98 
 
 		 310 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.727025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1048  Fis family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 287 aa  47  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0933  hypothetical protein  41.82 
 
 		 290 aa  47  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.846552  hitchhiker  0.0043077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0020  hypothetical protein  42.31 
 
 		 290 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0572  solute binding protein-like protein  32.35 
 
 		 344 aa  44.3  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1260  hypothetical protein  37.7 
 
 		 274 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1485  hypothetical protein  30 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.563194  normal  0.242902 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1111  hypothetical protein  36.67 
 
 		 303 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  44 
 
 		 285 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  30.61 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0857  hypothetical protein  40.35 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4608  IclR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 255 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.348784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>