20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0346 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0346  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 313 aa  599  1e-170  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1776  transcriptional regulator, TrmB  47.48 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0136034  normal  0.0115513 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1250  transcriptional regulator, TrmB  41.98 
 
 		 310 aa  225  7e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.727025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0198  transcriptional regulator, TrmB  42.99 
 
 		 305 aa  212  7e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.613545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0725  transcriptional regulator, TrmB  53.97 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.872668 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2298  transcriptional regulator, TrmB  52.46 
 
 		 118 aa  63.9  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00618378 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1111  hypothetical protein  48.39 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1940  transcriptional regulator, TrmB  41.41 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.600204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2070  transcriptional regulator, TrmB  53.33 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0181  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 140 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.152523 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1260  hypothetical protein  51.56 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0572  solute binding protein-like protein  37.14 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1485  hypothetical protein  42.86 
 
 		 172 aa  50.8  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.563194  normal  0.242902 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0034  hypothetical protein  39.34 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0561  hypothetical protein  43.33 
 
 		 157 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0291  hypothetical protein  35 
 
 		 327 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0732  hypothetical protein  40.91 
 
 		 163 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000258314 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1547  hypothetical protein  35.53 
 
 		 246 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 182 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1887  ArsR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 127 aa  42.7  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>