45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1887 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1887  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 127 aa  260  4.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  57.43 
 
 		 116 aa  123  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3885  ArsR family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11439  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  54.64 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1954  transcriptional regulator, ArsR family  50.53 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0543134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1455  transcriptional regulator, ArsR family  55.06 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9201  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 109 aa  94  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.437211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8713  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0202623  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0641  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3558  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.406985 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0433  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 		 100 aa  50.1  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 105 aa  50.1  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1986  transcriptional regulator, TrmB  28.92 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1330  regulatory protein, ArsR  32.18 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  30.59 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  30.95 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1561  regulatory protein ArsR  32.47 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.442352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  45 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.25 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  34.94 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.35 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  31.62 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1374  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 218 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.650648  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1231  transcriptional regulator, TrmB  37.14 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0346  transcriptional regulator, TrmB  48.78 
 
 		 313 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 113 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 317 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.88 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.88 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4090  hypothetical protein  39.19 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904998  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0472  ArsR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 239 aa  40.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  41.89 
 
 		 166 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1621  hypothetical protein  36.05 
 
 		 116 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>