20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1986 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1986  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 102 aa  201  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1330  regulatory protein, ArsR  65.96 
 
 		 107 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  34.15 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1561  regulatory protein ArsR  30.3 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.442352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3885  ArsR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11439  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  32.29 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1954  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0543134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0433  regulatory protein, ArsR  30.85 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9201  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.437211 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3558  ArsR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 97 aa  50.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.406985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1887  ArsR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  34.02 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1455  transcriptional regulator, ArsR family  27.38 
 
 		 122 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1374  transcriptional regulator, MarR family  45.28 
 
 		 218 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.650648  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1936  transcriptional regulator, ArsR family  39.66 
 
 		 109 aa  41.2  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20640  regulatory protein ArsR  34.55 
 
 		 310 aa  40.8  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>