60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1954 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1954  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 108 aa  213  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0543134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9201  ArsR family transcriptional regulator  73.33 
 
 		 109 aa  154  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.437211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8713  transcriptional regulator, ArsR family  61.05 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0202623  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3885  ArsR family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 116 aa  107  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11439  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  50.93 
 
 		 116 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1887  ArsR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  56.47 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1455  transcriptional regulator, ArsR family  48.24 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  41.38 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0641  hypothetical protein  57.45 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3558  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.406985 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1986  transcriptional regulator, TrmB  31.03 
 
 		 102 aa  52.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  34.88 
 
 		 101 aa  51.2  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1330  regulatory protein, ArsR  31.46 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  32.95 
 
 		 227 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1222  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 300 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  39.62 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0433  regulatory protein, ArsR  29.89 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  43.64 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  32.18 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  55.88 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  42.31 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 119 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 107 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  42.37 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1936  transcriptional regulator, ArsR family  43.86 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0909  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 228 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000018626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 297 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 317 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  33 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0803  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 181 aa  40.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 122 aa  40.4  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  38.18 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  34.38 
 
 		 339 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 342 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  38.33 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 339 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 151 aa  40  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1374  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 		 218 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.650648  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  41.82 
 
 		 144 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 158 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 103 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 155 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>