90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0888 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  100 
 
 
93 aa  185  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3558  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
97 aa  77  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.406985 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0433  regulatory protein, ArsR  38.71 
 
 
100 aa  63.5  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1561  regulatory protein ArsR  32.97 
 
 
100 aa  62.8  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.442352  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  38.82 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1954  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0543134  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1222  transcriptional regulator, ArsR family  44.07 
 
 
300 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3139  transcriptional regulator, PadR-like family  37.33 
 
 
77 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0099  transcriptional regulator, PadR-like family  35.82 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  40.68 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3885  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11439  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  32.86 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  29.41 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1182  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00795875  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12071  ArsR-type repressor protein  30.86 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  34.48 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0946  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 
171 aa  45.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20640  regulatory protein ArsR  31.08 
 
 
310 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9201  ArsR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.437211 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1887  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
192 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  33.7 
 
 
104 aa  43.9  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0129  regulatory protein, ArsR  37.66 
 
 
157 aa  43.5  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.29 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.96 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  38.78 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  28.95 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  33.75 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  39.58 
 
 
107 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 
109 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1852  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
223 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.211312 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0140  Fis family transcriptional regulator  39.58 
 
 
181 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
113 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  32.69 
 
 
103 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2669  regulatory protein ArsR  28.92 
 
 
86 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311872  normal  0.215789 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
114 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4017  regulatory protein, ArsR  36 
 
 
190 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94661  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8713  transcriptional regulator, ArsR family  27.38 
 
 
103 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0202623  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1455  transcriptional regulator, ArsR family  31.17 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566564  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
323 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3678  transcriptional regulator ArsR family  28.74 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1497  transcriptional regulator  31.71 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  31.88 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1532  hypothetical protein  31.71 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0803  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
181 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1651  hypothetical protein  31.71 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11220  regulatory protein ArsR  32.88 
 
 
358 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 
312 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2324  transcriptional regulator, ArsR family  31.15 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1718  hypothetical protein  31.71 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1796  hypothetical protein  31.71 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  35.85 
 
 
330 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1723  transcriptional regulator  33.85 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000132397  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3928  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
107 aa  40.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.479587 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
297 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5889  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 
307 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1374  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 
218 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.650648  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6802  transcriptional regulator, ArsR family  41.51 
 
 
307 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1739  hypothetical protein  31.71 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0385114  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1646  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1142  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.629326  normal  0.465859 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
503 aa  40.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1506  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0520742  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1286  transcriptional regulator, ArsR family/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  36.84 
 
 
244 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287938  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
110 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
84 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 
139 aa  40  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
329 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>