80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3885 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3885  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 116 aa  233  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11439  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  89.66 
 
 		 116 aa  209  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1887  ArsR family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  55.21 
 
 		 115 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1455  transcriptional regulator, ArsR family  56.18 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1954  transcriptional regulator, ArsR family  54.81 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0543134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9201  ArsR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.437211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8713  transcriptional regulator, ArsR family  51.06 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0202623  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0641  hypothetical protein  47.46 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3558  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.406985 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  35.87 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  31.25 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1986  transcriptional regulator, TrmB  31.4 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  35.48 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0433  regulatory protein, ArsR  35.8 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1561  regulatory protein ArsR  33.7 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.442352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1330  regulatory protein, ArsR  35.62 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  29.41 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  30.77 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  32.32 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  31.31 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2592  regulatory protein ArsR  38.96 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.108396 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  32.32 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  30.48 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0909  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 228 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000018626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1222  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 300 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  34.33 
 
 		 208 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  46.67 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  32.84 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  41.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  35.05 
 
 		 110 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 122 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 		 139 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 110 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 317 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  33.02 
 
 		 109 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  32.18 
 
 		 120 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 169 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1723  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000132397  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 207 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  32.84 
 
 		 207 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  34 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  35.63 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  29.11 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 207 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 207 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 207 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  43.86 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  30.26 
 
 		 106 aa  40.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 224 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  44.83 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 		 699 aa  40.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  31.58 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 207 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1374  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 218 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.650648  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4286  transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 		 118 aa  40  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  36.21 
 
 		 98 aa  40  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  33.9 
 
 		 91 aa  40  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7857  hypothetical protein  44.44 
 
 		 293 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 92 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>