17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1330 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1330  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 107 aa  208  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1986  transcriptional regulator, TrmB  65.96 
 
 		 102 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0433  regulatory protein, ArsR  32.61 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  34.69 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3558  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.406985 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1954  transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0543134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1561  regulatory protein ArsR  32.22 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.442352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3885  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11439  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9201  ArsR family transcriptional regulator  31 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.437211 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  40.51 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  35.62 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1887  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1455  transcriptional regulator, ArsR family  31.17 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1374  transcriptional regulator, MarR family  43.02 
 
 		 218 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.650648  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1852  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 		 223 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.211312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>