58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1852 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1852  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 223 aa  447  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.211312 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1374  transcriptional regulator, MarR family  60.09 
 
 		 218 aa  227  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.650648  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0588  transcriptional regulator, MarR family  58.77 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2977  transcriptional regulator, ArsR family  55.92 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381665  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3005  transcriptional regulator, MarR family  54.93 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00979308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0909  ArsR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000018626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0612  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2633  ArsR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1236  ArsR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.348841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1711  regulatory protein, ArsR  54.55 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1567  regulatory protein, ArsR  49.35 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2059  transcriptional regulator, ArsR family  53.97 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0682  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 97 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1464  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 97 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 117 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  43.55 
 
 		 105 aa  50.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  44.26 
 
 		 105 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 127 aa  48.1  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 123 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 106 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 105 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 111 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  43.1 
 
 		 107 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 110 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 110 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 111 aa  45.8  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 134 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 107 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 121 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 		 101 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 118 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 115 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 485 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  39.53 
 
 		 105 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  44.07 
 
 		 124 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 117 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  38.81 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 109 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  35.82 
 
 		 113 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 122 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 122 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 122 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3387  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 96 aa  42.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  32.53 
 
 		 120 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 		 140 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 111 aa  42.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 437 aa  42.4  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 118 aa  42.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 120 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 188 aa  42.4  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 		 93 aa  42  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 112 aa  42  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0818  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 139 aa  42  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  38.67 
 
 		 109 aa  42  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  35.14 
 
 		 129 aa  42  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 111 aa  41.6  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 132 aa  41.6  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>