101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2977 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2977  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
219 aa  442  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381665  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0588  transcriptional regulator, MarR family  84.86 
 
 
218 aa  359  2e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1374  transcriptional regulator, MarR family  61.29 
 
 
218 aa  256  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.650648  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1852  transcriptional regulator, ArsR family  56.4 
 
 
223 aa  232  3e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.211312 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3005  transcriptional regulator, MarR family  53.49 
 
 
216 aa  211  4.9999999999999996e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00979308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0909  ArsR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000018626  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2633  ArsR family transcriptional regulator  37.26 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0612  ArsR family transcriptional regulator  41.88 
 
 
204 aa  100  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1711  regulatory protein, ArsR  54.55 
 
 
213 aa  92.4  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1236  ArsR family transcriptional regulator  52.56 
 
 
217 aa  89.7  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.348841  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1567  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
207 aa  87  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2059  transcriptional regulator, ArsR family  50.67 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1464  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
97 aa  59.7  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0682  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 
97 aa  59.3  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
117 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
105 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  41.27 
 
 
105 aa  49.3  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  41.03 
 
 
109 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
112 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
134 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
121 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
107 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 
485 aa  48.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  39.66 
 
 
107 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
105 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  40 
 
 
106 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  43.64 
 
 
115 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6743  transcriptional regulator, ArsR family  43.94 
 
 
137 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.661837 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
112 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
111 aa  46.6  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  38.24 
 
 
99 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  38.24 
 
 
99 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  38.24 
 
 
99 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  38.24 
 
 
99 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  38.24 
 
 
99 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  38.81 
 
 
121 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  34.78 
 
 
116 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  46.55 
 
 
110 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  46.55 
 
 
110 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 
127 aa  46.2  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  44.23 
 
 
112 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5809  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
112 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522753  normal  0.488777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5816  transcriptional regulator, ArsR family  38.81 
 
 
129 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  44.07 
 
 
124 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
192 aa  45.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
111 aa  45.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  43.28 
 
 
105 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  44.26 
 
 
111 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
109 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
123 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  40.62 
 
 
117 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
130 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  26.97 
 
 
113 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  40 
 
 
131 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
121 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1330  regulatory protein, ArsR  42.05 
 
 
107 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  35.82 
 
 
113 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1986  transcriptional regulator, TrmB  45.28 
 
 
102 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  41.07 
 
 
111 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  34.43 
 
 
118 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 
129 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  32.86 
 
 
120 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0818  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
139 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  37.18 
 
 
101 aa  43.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 
118 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  44.78 
 
 
107 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 
118 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  38.81 
 
 
113 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  32.86 
 
 
115 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 
118 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1812  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 
141 aa  43.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122614  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
111 aa  42.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3885  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
116 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11439  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 
106 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4734  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 
118 aa  42.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194838  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
437 aa  42.7  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1391  transcriptional regulator, ArsR family  31.43 
 
 
85 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018666  unclonable  0.00000780162 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 
146 aa  42.4  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
132 aa  42.4  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
86 aa  42.4  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  39.22 
 
 
93 aa  42.4  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  35.38 
 
 
132 aa  42.4  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
106 aa  42.4  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  38.71 
 
 
118 aa  42  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
116 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
103 aa  42  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
114 aa  42  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  32.31 
 
 
113 aa  42  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  32.88 
 
 
116 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11220  regulatory protein ArsR  31.94 
 
 
358 aa  42  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  38.81 
 
 
117 aa  42  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2275  ArsR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
105 aa  42  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  34.15 
 
 
104 aa  42  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  38.6 
 
 
339 aa  41.6  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1750  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 
159 aa  41.6  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
91 aa  41.6  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
127 aa  41.6  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
110 aa  41.6  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1887  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
127 aa  41.6  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>