108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0588 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0588  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 218 aa  436  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2977  transcriptional regulator, ArsR family  84.86 
 
 		 219 aa  344  5e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381665  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1374  transcriptional regulator, MarR family  62.21 
 
 		 218 aa  256  3e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.650648  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1852  transcriptional regulator, ArsR family  58.77 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.211312 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3005  transcriptional regulator, MarR family  58.14 
 
 		 216 aa  219  3e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00979308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0909  ArsR family transcriptional regulator  68.6 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000018626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2633  ArsR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0612  ArsR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1236  ArsR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.348841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1711  regulatory protein, ArsR  53.25 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1567  regulatory protein, ArsR  50.63 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2059  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1464  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 97 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0682  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 117 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 105 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 112 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6743  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 		 137 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.661837 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 485 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  41.27 
 
 		 105 aa  48.9  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 134 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 121 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 		 188 aa  48.5  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 107 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  41.38 
 
 		 107 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  48.28 
 
 		 110 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  48.28 
 
 		 110 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 127 aa  47  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  39.74 
 
 		 109 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 112 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  45.76 
 
 		 124 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 112 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 105 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  38.24 
 
 		 99 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  38.24 
 
 		 99 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  38.24 
 
 		 99 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  38.24 
 
 		 99 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  38.24 
 
 		 99 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  41.82 
 
 		 115 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  38.46 
 
 		 106 aa  45.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  37.31 
 
 		 121 aa  45.4  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 109 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 123 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  44.26 
 
 		 111 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 116 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5809  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 112 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522753  normal  0.488777 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  35.38 
 
 		 111 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 131 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 		 116 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  43.28 
 
 		 105 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 129 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 121 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 111 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  40.62 
 
 		 117 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 		 101 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1330  regulatory protein, ArsR  42.05 
 
 		 107 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 437 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4079  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 		 118 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0764894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5816  transcriptional regulator, ArsR family  37.31 
 
 		 129 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  26.97 
 
 		 113 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 		 97 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 106 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 132 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  34.33 
 
 		 113 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1391  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 		 85 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018666  unclonable  0.00000780162 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  44.23 
 
 		 106 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  38.81 
 
 		 113 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  32.86 
 
 		 120 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 130 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  32.79 
 
 		 118 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 		 93 aa  42.7  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 112 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  36.99 
 
 		 116 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 107 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 118 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 111 aa  42.4  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 118 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 113 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 106 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 106 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 106 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 106 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0818  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 139 aa  42.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 		 106 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 86 aa  42  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 118 aa  42  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  32.86 
 
 		 115 aa  42  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  38.81 
 
 		 117 aa  42  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  42.86 
 
 		 118 aa  42  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 107 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 107 aa  41.6  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 107 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3088  regulatory protein, ArsR  46.55 
 
 		 124 aa  42  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  36.99 
 
 		 146 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  33.82 
 
 		 107 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  33.82 
 
 		 107 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  33.82 
 
 		 107 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  33.82 
 
 		 107 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3387  transcriptional regulator, ArsR family  36.21 
 
 		 96 aa  42  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>