25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1567 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1567  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 207 aa  410  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2059  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1711  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 213 aa  181  8.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2633  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 206 aa  167  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1236  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.348841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1374  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.650648  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3005  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 216 aa  84.7  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00979308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0909  ArsR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000018626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0612  ArsR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1852  transcriptional regulator, ArsR family  49.35 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.211312 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0588  transcriptional regulator, MarR family  50.63 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2977  transcriptional regulator, ArsR family  50.63 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381665  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1295  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 110 aa  46.6  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 106 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  31.94 
 
 		 113 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 121 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 134 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 107 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 117 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  31.34 
 
 		 113 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2860  ArsR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 115 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  33.85 
 
 		 105 aa  42  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 107 aa  41.6  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1560  regulatory protein ArsR  30.77 
 
 		 180 aa  41.6  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.964745  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1464  transcriptional regulator, ArsR family  30.99 
 
 		 97 aa  41.2  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>