40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0612 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0612  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
204 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0909  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
228 aa  150  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000018626  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1374  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 
218 aa  123  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.650648  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1852  transcriptional regulator, ArsR family  38.83 
 
 
223 aa  117  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.211312 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3005  transcriptional regulator, MarR family  37.16 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00979308  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0588  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1236  ArsR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
217 aa  88.2  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.348841  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2633  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1567  regulatory protein, ArsR  31.68 
 
 
207 aa  85.9  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2977  transcriptional regulator, ArsR family  34.39 
 
 
219 aa  85.1  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381665  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2059  transcriptional regulator, ArsR family  31 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1711  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 
213 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0682  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
97 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1464  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 
97 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  39.71 
 
 
101 aa  47.8  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 
105 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
121 aa  45.1  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
117 aa  45.1  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
105 aa  45.1  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
437 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  37.7 
 
 
105 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
117 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  35.82 
 
 
118 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  37.68 
 
 
97 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 
152 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
122 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
122 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2818  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 
91 aa  42.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.215326  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
122 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1359  ArsR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
225 aa  42.7  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.390289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1099  ArsR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
359 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967799  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  40.35 
 
 
120 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 
120 aa  42.4  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 
130 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  26.04 
 
 
317 aa  41.6  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  38.98 
 
 
100 aa  41.6  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  37.1 
 
 
103 aa  42  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
123 aa  41.2  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5809  transcriptional regulator, ArsR family  38.18 
 
 
112 aa  41.2  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522753  normal  0.488777 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4734  regulatory protein, ArsR  39.68 
 
 
118 aa  41.2  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>