More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4480 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 152 aa  281  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  62.24 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  57.29 
 
 		 105 aa  90.9  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 142 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  50.5 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  48.91 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2848  transcriptional regulator, ArsR family  49.07 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000188384  normal  0.0300767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  41.9 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  45.54 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 116 aa  73.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 257 aa  72  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  32.04 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1799  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  43.88 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  41 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  36.7 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  36.7 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0625  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.906206 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  46.34 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  46.34 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6292  transcriptional regulator, ArsR family  42.73 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  33 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  54.84 
 
 		 267 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3793  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  38.54 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 		 263 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3353  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  37.11 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1116  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  37.86 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1475  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  27.84 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1120  transcriptional regulator, ArsR family  32.73 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.360075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  36.28 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  39.05 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  35.92 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  46.07 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  36.67 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  30.53 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  32.61 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  34.58 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  31.46 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2602  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2464  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>